Laboratory of Computational Biology

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Seoul National University
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Publications+ more

(2019) Identification of tumor suppressor microRNAs by integrative microRNA and mRNA sequencing of matched tumor-normal pairs in lung adenocarcinoma, Molecular Oncology
(2019) Interpretation of EBV infection in pan-cancer genome considering viral life cycle: LiEB (Life cycle of Epstein-Barr virus), Scientific Reports
(2019) Comparison of INDEL calling tools with simulation data and real short-read data, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
(2017) Rules for functional microRNA targeting, BMB reports
(2017) Korean Variant Archive (KOVA): a reference database of genetic variations in the Korean population, Scientific Reports

Welcome to the
"Laboratory of Computational Biology"

최근 들어 고성능 염기서열 결정법(next-generation sequencing)이 널리 활용됨에 따라 바이오 빅데이터가 쏟아져 나오고 있으며, 이에 따라 현대 생물학은 혁명적 변화를 맞이하고 있다. 이들 방대한 규모의 바이오 빅데이터 안에서 생물학적으로 의미있는 정보를 얻어내기 위해 전산학과 통계학적 접근법이 필요하게 되었고, 그 결과 생물정보학이라는 학문이 탄생하게 되었다. 우리 연구실은 생물정보학적 분석방법을 적극 활용하여 다양한 분야의 생명 현상들을 규명하고 있다. 특히, 대규모 transcriptome과 proteome 데이터를 이용하여 microRNA 및 RNA 결합 단백질에 의한 유전자 발현 조작을 연구하고 있다. 또한, 대규모 암 유전체 데이터를 분석하여 발암 돌연변이를 발굴하고 암 발생 기작을 규명하고자 노력하고 있다. Computational Biology and Bioinformatics - Large-scale sequence analysis - Bio big data: genome, transcriptome, and proteome Noncoding Genome - MicroRNA targeting and biogenesis- Other non-coding RNAs- RNA-binding proteins- Alternative mRNA splicing and alternative promoters Cancer Genomics - Whole exome and genome analysis- Development of cancer genome analysis software (Details in ‘Research’ board)