RNA-binding protein(RBP)은 mRNA 및 기타 RNA와 상호 결합하여 전사 발현 조절, splicing 조절, 번역 조절 등의 기능을 수행한다. 최근 crosslinking and immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing(CLIP-seq)이 개발되고, 이를 더욱 발전시킨 iCLIP이나 eCLIP 기술의 발달로 인해, 여러 RBP들이 어떤 RNA들에 결합하는지에 대한 구체적 위치 정보를 nucleotide 수준에서 관찰할 수 있게 되었다. 본 연구실에서는 iCLIP이나 eCLIP 실험을 통해 얻어진 바이오 빅데이터를 분석하여 RBP의 기능을 규명하고, RBP의 결합이 유전자 발현 조절에 미치는 영향을 연구하고 있다.
(Flowchart for discovery of RBP functions in omics scale, plot by Sukjun Kim)
(Basic statistics for eCLIP-seq data, plot by Sukjun Kim)