김선영 교수의 관심 분야는 인간(혹은 기타 동물)에서 유전자가 어떻게 발현되고 조절되는가를 연구하여 각종 생명 현상 및 질병의 원리를 이해하고, 이를 바탕으로 신약 혹은 신기능소재들을 개발하는 것입니다. 1992년 서울대학교에서 시작된 김교수 연구실은 약 5년을 주기로 기초와 응용의 비중이 바뀌어 왔습니다. 1992년 귀국 후 첫 5년은 기초과학적 프로젝트가 많았고, 그 다음 5년은 기초와 응용이 1:1, 그 다음 5년은 응용 프로젝트의 비중이 커졌습니다. 김선영 교수 연구실은 세계적으로도 보기 드문 biotechnology lab이 되었습니다. 그의 연구실에서 수행된 연구성과에 기초하여 2개의 벤처기업이 설립되었고, 그 중 하나는 2005년 12월 코스닥에 등록되었습니다. 이를 바탕으로 10 여개에 가까운 신약 혹은 기능성 소재가 개발되었고, 미국, 한국, 중국 등지에서 수행중인 임상시험만 6건이 넘습니다. 대학의 조그만 연구실에서 이런 성과가 얻어졌다는 것은 세계적으로도 유례를 찾아보기 힘듭니다. 김선영 교수 연구실에서 대학원생은 ‘독립적인 연구자’ 가 되기 위한 훈련을 받습니다. 일단 신입생으로 연구실에 들어오면 3-6개월간 기본훈련을 받고 자신의 프로젝트를 받습니다. 김 교수는 세밀한 사항까지 대학원생들을 지도하지는 않습니다.