다음 연구들은 한국연구재단과 서울대학교에서 받은 기금으로 수행되고 있다.
l 한국, 일본, 몽골, 중국, 말레이시아 등에서 채취된 샘플을 통해 아시아 전역에 걸친토양 고세균의 다양성 패턴에 관한 조사.
l 유전체학과 단일세포 분류기술(single cell sortingtechnique)을 이용, 한국 해안에서 채취된 와편모충(渦鞭毛蟲, dinoflagellates)과 원핵생물의 공생관계, 상리공생관계, 기생관계, 포식자 피식자 관계 정립에 대한 연구
l 중국 남부 아열대 지방의 다양한 조림지에서 수행되는 연구로, 나무종의 자원이 되는 leaf litter에 특이적인 박테리아와 균류 군집에 대한 연구.
l 일본의 화산재에서 형성되는 고세균과 박테리아 군집에 관한 연구.
l 박테리아와 고세균 군집에 대해 기질의 특성 외에 단기적 기후 변화에 대한 영향을 알아보기 위해 수행된 soil translocation experiment. 이 연구에서 우리는 일본 Norikura산에서 각각 높은 고도와 낮은 고도에서 채취된 토양을 서로 바꾸어보는 실험을 수행했다.
l 최근 증가된 대기 이산화탄소로 인한 바다물의 산성화가 해양 표면 퇴적물속 미생물 군집에 대해 미치는 영향에관한 연구.
l 한국의 온대성 나무 뿌리 표면에서의 고세균 군집에 대한 연구
l 토양 박테리아 군집에 탄소나노튜브 오염이 미치는 영향.