Professor

김종서

책임연구교수

김종서 Jong-Seo Kim

김종서
연구분야
  1. LC-MS/MS의 분석감도/처리효율 향상을 위한 분석화학 연구
    1) 액체크로마토그래피의 분리능 향상
    2) 자동화/온라인 다중LC시스템 연구

  2. RNA-단백질 상호작용의 질량분석법 개발연구
    1) 포름알데히드 교차결합에 기반한 mRNA결합단백질 프로파일링 (FAX-RIC)
    2) 부위특이적 RNA결합단백질 동정 (TAIL-MS & CAP-MS)
    3) RNA결합자리 및 결합도메인 동정법 개발

  3. 초다중 정량단백체학 플랫폼 개발
    1) 전산알고리즘 개발 (EPIQ)
    2) 초다중 화학표지법 개발 (>6plex)
    3) 초다중 대사표지법 개발 (>6plex SILCA)

  4. 근접표지법에 기반한 RNA-단백체학 연구 (Proximity labeling)
    1) P-body 단백체 프로파일링
    2) 세포소기관 내의 RNA결합단백질 프로파일링
학력/경력
학력
  • - 2002.3 – 2007.8 박사: 서울대학교 화학부 분석화학
  • - 2000.3 – 2002.2 석사: 서울대학교 화학부 분석화학
  • - 1996.3 – 2000.2 학사: 서울대학교 자연과학부 화학전공
경력
  • - 2013.3 – present 서울대학교 IBS RNA연구단, 책임연구교수
  • - 2008.10 – 2013.2 Pacific Northwest National Laboratory, 박사후연구원
  • - 2007.9 – 2008.9 서울대학교 화학부, 박사후연구원
  • - 2007.9 – 2008.8 서울대학교 화학부, 시간강사
주요논문
  1. Lee SY, Kang MG, Shin S, Kwak C, Kwon T, Seo JK, Kim JS*, Rhee HW*, "Architecture Mapping of the Inner Mitochondrial Membrane Proteome by Chemical Tools in Live Cells" , J Am Chem Soc, 2017 Mar; 139(10):3651–62
  2. Kim JS, Dai Z, Aryal UK, Moore RJ, Camp DG, Baker SE, Smith RD, Qian WJ, “Resin-assisted enrichment of N-terminal peptides for characterizing proteolytic processing”, Anal Chem, 2013 Jul;85(14):6826–32.
  3. Kim JS, Monroe ME, Camp DG 2nd, Smith RD, Qian WJ, “In-source fragmentation and the sources of partially tryptic peptides in shotgun proteomics”, J Proteome Res, 2013 Feb;12(2):910-6.
  4. Kim JS, Song JS, Kim Y, Park SB, Kim HJ, “De novo analysis of protein N-terminal sequence utilizing MALDI signal enhancing derivatization with Br signature", Anal Bioanal Chem, 2012 Feb;402(5):1911-9.
  5. Kim JS, Fillmore TL, Liu T, Robinson E, Hossain M, Champion BL, Moore RJ, Camp DG 2nd, Smith RD, Qian WJ, “18O-labeled proteome reference as global internal standards for targeted quantification by selected reaction monitoring-mass spectrometry”, Mol Cell Proteomics, 2011 Dec;10(12):M110.007302.